《心靈深處》的詞曲都是由林夕和陳奕迅合作完成，以下是歌曲的詞語編寫：
風一吹，一團火滅了，
星星在看著，照不亮路，
握著半生經驗，忘了路上的結束，
走了千裡遠，我們去來的地方嗎？
情緒風暴之間，心跳過山車，
從眼眶流下熱水，愛情太深了，
你心靈深處有個孩子，總想讓它哭，
愛情是座墳墓，讓我們相依為命吧。
風一吹，一場夢醒了，
我們在看著，明天的風雨，
握著半生經驗，忘了路上的結束，
愛情是座墳墓，讓我們相依為命吧。
我們的心靈深處總有個孩子，總想讓它哭，
我們的愛情總是讓我們相依為命。
我們的心靈深處總有個夢，夢裏我們擁有整個世界。
我帶著你走，永遠不要迷失了回家的路。
走著不過要忍著，經驗裡有一點悲喜交集，
時間久了就能明白了，一生當中的長跑當中終點並非最好過初稿。
生活還得繼續，愛情還得相依為命。
以上就是《心靈深處》的詞語編寫，歌曲表達了對愛情的感慨和對生活的感悟。