《牡丹江》的意境主要描述了一段跨越時空的異地相思。歌曲以女孩的口吻表達了對遠在他鄉戀人的思念，以及在相思之苦中不斷回憶和想像出的與戀人重逢的場景。
歌詞中“你要去哪裡呀去那牡丹江”表現了女孩對戀人工作地的關心和嚮往，“那么傷感的地方那么美”既寫出了異地戀的痛楚，也寫出了對未來的期待，畢竟牡丹江作為一方熱土在遠方愛人心中仍是最美。另外，“下雨的時候你想我嗎？你快樂嗎你幸福嗎”更是體現了女子對男方強烈的關心和思念，但恨人不在身邊，無法親吻愛人，無法給她一個擁抱，只能通過歌聲傳達自己的思念。
總的來說，《牡丹江》這首歌的歌詞意境深遠，既有相思之苦的表達，也有對美好未來的想像和期待。