中國科學技術大學的校歌是《永恆的旋律》。其歌詞如下：
波光粼粼，書聲琅琅，校園裡歌聲笑語迴蕩。
這裡是我們嚮往的地方，永恆的旋律，鑄就輝煌。
勤奮求實，開拓創新，追求卓越，永不言敗。
我們的信念如磐如鐵，拼搏進取，奮發向前。
團結協作，眾志成城，攻堅克難，砥礪前行。
我們的團隊無比堅強，為了夢想，勇往直前。
在科大這片沃土上，我們攜手並進，
探索未知，追逐夢想，向著未來奮勇前行。
中國科大，我們永遠的家，
為了夢想，為了明天，我們在這裡起航。