長庚科大校歌的歌詞如下：
百年的風雨，百年的滄桑，
鑄就了長庚的輝煌。
博學敬業，嚴謹創新，
傳承著醫者的榮光。
莘莘學子，揚帆遠航，
醫路相伴，情深意長。
團結奮進，求實創新，
追求卓越，長庚至上。
長庚科大，我們的家園，
肩負使命，鑄就未來。
長庚科大，我們的驕傲，
揚帆起航，再創輝煌。