《怪醫黑傑克》的主題曲是《怪醫黑傑克》，歌詞如下：
Verse 1：
神秘的黑衣人 出現在夜幕
他有著神奇的力量 拯救人們生命
無論多么危險 無論多么痛苦
他都能化險為夷 拯救人們於水火
Chorus：
他是怪醫黑傑克 無人能及的醫生
他是人們的救星 帶來希望的使者
Verse 2：
他有著獨特的醫術 有著獨特的眼光
他能夠看穿病情 找到問題的根源
他不怕困難 不怕挑戰
他有著堅定的信念 拯救人們的生命
Chorus：
他是怪醫黑傑克 無人能及的醫生
他是人們的救星 帶來希望的使者
Bridge：
他的名字傳遍世界 他的故事感動人心
他是人們的英雄 他是人們的希望
Chorus：
他是怪醫黑傑克 無人能及的醫生
他是人們的救星 帶來希望的使者
Outro：
他是怪醫黑傑克 他是人們的英雄。