五月天《雌雄同體》的詞意主要是描述一個人內心深處的兩面性，一面是溫柔、體貼、細膩、母性的一面，另一面是野蠻、豪放、不拘一格的一面，就像男女交融的雙性同體一樣。它還歌頌了自由和勇於追求自己想要的生活的態度，不畏人言，活出真我。這首歌也向所有的同性或異性表示愛意，因為愛沒有性別之分。
這首歌的詞語幽微，充滿了矛盾與對立，卻又能和諧共生。它反映了人性多面的真實面貌，並且提出了性取向、性別身份等議題，值得所有人去深思和反思。