三芝國小校歌的歌詞是：
白沙磺統境，金瓜石屏前。
福山風光秀，五義顯威權。
百代相傳興文化，英雄無畏敢當先。
百年三小展雄風，勤教求真創未來。
校歌的旋律歡快激昂，展現了學校的教育理念和學生的精神風貌。